Visores moleculares I

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	ATOM IN MOLECULES 2000
Gran programa multifunción que destaca por la gran cantidad de parámetros sobre los que podemos tener incidencia. Permite excelentes visualizaciones 2D y 3D, determinando los parámetros a representar de los átomos.

	RASMOL
Excelente visualizador en 3D de moléculas en formato pdb, ent, alc, mol, mdl, xyz y chm. Existen versiones para Win3.1x, para Win95, Mac, Unix y otros. En sus páginas encontrarás múltiple información, incluso en castellano, así como moléculas.

Más sobre RASMOL
Manual	Configuración para Netscape	Accesorios	Animaciones

	WEB LAB VIEWER PRO
Extraordinario visualizador , que soporta más formatos que RasMol. Permite giro de moléculas automático, introducción de textos y más posibilidades. Existen tres opciones: Web Lab Viever Pro, no gratuita, que permite crear moléculas. Se puede bajar una demo o una copia gratuita de la versión Lite.

SITIOS PARA OBTENER MOLÉCULAS PARA AMBOS PROGRAMAS

PDB WWW Homepage	Okanagan University College
Mathmol	Los veinte aminoácidos
Lycoming Chemistry	MSI: creadores de Web Lab Viewer

	MOVIEMOL
Programa que permite realizar animaciones moleculares, indicando los átomos que existen en cada ventana, por medio de sus coordenadas. En la homepage se pueden conseguir ejemplos de animaciones. Las animaciones creadas tienen formato MPEG. En un futuro, tal y como se indica en su web, podrá interactuar con Java. Aquí puedes conseguir el manual (HTML), o también en la página de origen.

	SWISS PDVIEWER
Otro interesante programa de visualización de libre distribución creado en el Geneva Biomedical Reseach Institute. Visualiza formato PDB, y soporta algunos más. Interactúa con PovRay. Presenta un montón de posibilidades en cuanto al trabajo con moléculas. En su página, bajas el manual y PovRay. Necesita instalar previamente QuickDraw 3.0 para su correcto funcionamiento.

	MOLGEN
Interesante programa que consta de tres partes: 1.-Molgen: al introducir una fórmula, calcula el nº de isómeros. 2.- Molview: visualiza cualquiera de los isómeros hallados. 3.- Moled: permite modificar la estructura de los isómeros. Se baja una demo que solo representa 6 isómeros. Presenta una versión "on line" de búsqueda de isómeros, que necesita Chime para superfecta visualización.

	LACE 3D
Lmodeler es un programa que permite generar moléculas en tres dimensiones, partiendo de unos ejes x, y , z. Podemos controlar la posición de los ejes en pantalla, usando un cuadro de controles. Se puede usar dicho programa para realizar cualquier tipo de representación tridimensional de cualquier objeto. Puede bajarse un fichero llamado Lacepics.zip que incorpora moléculas tridimensionales ya realizadas.

	WINCHEM
Programa para representación y visualización de distintos compuestos en 2 dimensiones. Es un sencillo programa de representación, que permite la incorporación de textos en una ventana, relativos al gráfico representado.

	VIBRATIONS FOR WINDOWS
Es un programa que permite estudiar las vibraciones que se producen en los enlaces en las moléculas. Permite dibujar las moléculas y generar el sentido de la vibración. Presenta la posibilidad de trabajar con escalas. Posteriormente, ejecutamos el diseño y se observan dichos procesos de vibración molecular.

	VECTOR NTI VIEWER
Es un programa que representa moléculas complicadas. Permite interacciones con los navegadores más conocidos. Tengo que reconocer que es difícil de entender a primera vista y, realmente, no me he parado mucho con él. Sin embargo, presenta un tutorial, aunque parece complejo. A todas luces parece un programa interesantísimo, aunque como digo, no parece fácil hacerse con él. Os invito a bajároslo, y si llegáis a entenderlo, por favor, enviadme un mail. Existe una versión gratuíta, además de la profesional. Versiones para Mac y Win 3.1.

	MOL2MOL
Imprescindible programa de Compuchem, que permite transformar distintos formatos de los visualizadores y diseñadores tridimensionales de moléculas. Según su archivo de ayuda, soporta ¡23 formatos diferentes!, para realizar las transformaciones. Entre ellos se encuentran los más conocidos: PDB, Alchemy, HyperChem, Isis Draw, ChemDraft, ChemWindow, Mopac, etc. También lo puedes solicitar por mail a la empresa, desde la homepage.

	MOLOFFICE 97
Un excelente programa de Compuchem, para diseñar moléculas tridimensionales. Consta de dos partes: MolDraw, donde presenta las herramientas necesarias para el diseño de las moléculas y MolPIC, donde permite visualizar en tres diemnsiones, dichas moléculas, incluyendo una serie de informaciones sobre ellas: masa molecular, nombre, etc. Un programa realmente interesante.

	BABEL
Ante la gran cantidad de programas de visualización de moléculas, proliferan los distintos formatos: pdb, xyz, etc. Este es un excelente programa que permite transformar un formato en otro diferente, para que pueda visualizarse con otro programa. Existen versiones para Dos, Mac y Unix., que encontraréis en la dirección de bajada. Aquí encontraréis un manual,

	BONDIT
Excelente programa para construir las estructuras de Lewis de distintas moléculas. Podemos ir añadiendo átomo a átomo y veremos como se enlazan, observando los electrones de su última capa.

	PCMOLECULE
Este programa es un excelente visualizador de moléculas. Su formato es mcm, aunque soporta pdb. Existen tres posibilidades a bajar: el shareware (exige registrarse pagando), una demo del anterior y la versión Lite, totalmente funcional, que presenta las características típicas de este tipo de programas. En la página de bajada encontraréis enlaces a bases de datos de moléculas PDB y un manual.

	WINMOL
Programa que permite la visualización de átomos y moléculas. Es una versión Windows del conocido Xmol que corre en Unix. Permite crear frames de los cristales y, a partir de ellos, generar una animación. Trabaja con formato xyz.

	MOLSYM
Molecular Symmetry and Group Theory es un programa de estudio e investigación sobre la simetría y teoría de grupos de los cristales. Puede usarse tanto a nivel de profesores o estudiantes, como a nivel de trabajo específico en este campo de la Química. Presenta numerosas posibilidades de trabajo y es una herramienta imprescindible para el estudio cristalográfico. El programa está en inglés, aunque hay que resaltar que su autor es español.

	ALCHEMY 2000
Uno de los mejores programas de visualización molecular, que con su ultima actualización ha conseguido cotas elevadísimas. Permite trabajar con moléculas pequeñas hasta enormes moléculas complejas. Posee una excelente base de datos de moléculas, pudiéndose utilizar el programa para todo tipo de análisis. Entre sus posibilidades tenemos: dinámica molecular, búsqueda conformacional con asistente, interacciones intermoleculares, Internet Helper, lo que permite visualizar sus documentos en páginas web, etc

	ORBITAL VIEWER
Programa que permite visualizar los distintos orbitales atómicos de un átomo y los orbitales moleculares de moléculas sencillas. Fácilmente manejable y con una interfaz muy amigable, nos permite crear, con un efecto visual muy bien logrado, el orbital que deseemos que, además, podemos salvar para futuras ocasiones. Interesante programa gratuíto, con clara aplicación docente. En su página podemos obtener también figuras que representan los distintos tipos de orbitales.

Muchos más programas haciendo click en el banner. Elige Computational Chemistry

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